Juhatuse ülesandeks on Seltsi kui organisatsiooni arengu juhtimine ja Seltsi esindamine. Juhatus koosneb 2-5 liikmest, kes ei ole üldjuhul ise töögruppide juhid.
Töögruppide juhtide ülesandeks on meditsiinihariduse alavaldkondade arengu toetamine ja koordineerimine Eestis. Töögrupi juht on spetsialist, kellel on vastavas valdkonnas nii praktiline kogemus kui ka formaalne väljaõpe.
EMS on asutatud 06.06.2022. Täna on ametis EMSi II juhatus, mis valiti 19.08.2024 toimunud üldkoosolekul.
EMSi juhatus:
Joel Lumpre
Ave Kõrve-Noorkõiv
Kaie Stroo
E-mail: juhatus@medhar.ee